本书续《剑网尘丝》未完的故事。穆娟娟为获得心上人齐勒铭的爱，终生相守于一起，不惜捏碎了齐勒铭的琵琶骨，使之终生不能动武，却没想到武当五老及华山派门人先后前来寻仇，齐勒铭顿时陷入绝境中。幸得上官飞凤的救助，澄清了事实，并愿助齐勒铭恢复武功。穆娟娟对上官飞凤充满感激，性格上更是气味相投。
飞天神龙卫天元为报杀父之仇，冒着被清廷抓住的危险，公开向徐中岳挑战。秘魔崖下，各方当事人对质，终揭穿徐中岳和假翦大先生的面目，假翦大先生原是白驼山主的师兄慕容垂。而这时御林军统领穆志遥也安排高手，欲待机抓住卫天元，。上官飞凤现身，以“昆仑山上，幻剑灵旗；不奉灵旗，幻剑诛之”的偈语，驱散众高手。一番激战，慕容垂、徐中岳被卫天元、姜雪君所杀，而姜雪君也中毒身亡。
卫天元痛不欲生。幸得上官飞凤相救，使他有了求生的欲望，终于养好了伤，并与上官飞凤并骑南下，虽仍不免时时相信姜雪君，但对上官飞凤之情也与日俱增。终于卫天元向上官飞凤求婚，上官飞凤喜出望外，但是内心也感到隐忧。原来上官飞凤深爱着卫天元，但知道卫天元深爱的是姜雪君，而同时卫天元的师妹齐漱玉，则又深爱着卫天元。于是上官飞凤设下计谋，双管齐下，一方面是乘楚天舒与齐漱玉双双中毒之机，将二人救出，安排在一起，让齐、楚二人相互帮助并盼能日久生情，从而让卫天元少了一份爱的烦恼。另一方面，上官飞凤设计安排姜雪君的诈死，以绝卫天元之念。果然，一一都按照上官飞凤的安排实现了，虽然其中尚有一二意外，但却无关大局，被上官飞凤一一补救过来。
但没想到的是，白驼山主宇文雷的旧情人穆欣欣（穆好好及穆娟娟姐妹的姑姑，宇文雷叔父原白驼山主宇文博的姬妾）与徐中岳之妻赵红眉的姐姐赵青眉，假扮成上官飞凤与穆娟娟，到齐燕然家中偷袭，打死了齐燕然亲如手足的忠仆丁勃，架祸上官飞凤。致使齐燕然一气之下，赶到昆仑山星宿海，要打上官飞凤的父亲上官云龙决斗，以报丁勃无辜惨死之仇。两方一场生死决战而两败俱伤，幸好卫天元和上官飞凤及时赶到才避免了同归于尽，原来这一切全是出于白驼山主宇文雷的一手安排，同时鼓动上官云龙的副手盖覆天及西域十三家群起反对上官云凤而改奉白驼山。上官云龙和齐燕然两败俱伤后，盖覆天带人并白驼山的使者前来夺取灵旗，形势万分危急，好在得上官飞凤之助恢复武功的齐勒铭和穆娟娟赶到，挫败了盖覆天等人的阴谋。
然白驼山未灭，大敌尚在。且未死的姜雪君和师傅玉清神尼也正是隐居在那附近。因此，齐勒铭夫妇面对残棋般的复杂局面，决定让卫天元和楚天舒共赴白驼山，各凭缘份，同时也考察卫天元、楚天舒对上官飞凤、姜雪君、齐漱玉心中的感情。在齐勒铭的暗助下，历经一场场的生死磨难，白驼山主与其妻子穆好好及其旧情人穆欣欣之间数十年的感情纠缠，相互积怨而终中毒死于密室中，而御林军统领穆志遥亦正是由于受白驼山“神仙丸”之害而一步一步地走上自取灭亡之路。
姜雪君虽未死，但却已立志出家为尼，谢绝了卫天元的爱意，法名慧静。卫天元若有所悟，终于全心全意接纳了深爱着他的上官飞凤，虽然知道许多场景是由上官飞凤一手安排，但他终于也能够真正谅解她了，而楚天舒和齐漱玉也成就了美满姻缘。